Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox3aQ4TU90 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms