Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms