Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garnl3Q3V0G7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms