Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Hipk4Q3V016 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hipk4Q3V016 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms