Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc114Q3UX62 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms