Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Tmem253Q3UNB8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Tmem253Q3UNB8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Tmem253Q3UNB8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Tmem253Q3UNB8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Tmem253Q3UNB8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Tmem253Q3UNB8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Tmem253Q3UNB8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Tmem253Q3UNB8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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