Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trafd1Q3UDK1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms