Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Rnf180Q3U827 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Rnf180Q3U827 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Rnf180Q3U827 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Rnf180Q3U827 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Rnf180Q3U827 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Rnf180Q3U827 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Rnf180Q3U827 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Rnf180Q3U827 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf180Q3U827 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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