Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ssbp4Q3U4B1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssbp4Q3U4B1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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