Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J0

Slc38a5, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a5Q3U1J0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a5Q3U1J0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms