Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccndbp1Q3TVC7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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