Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fndc4Q3TR08 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fndc4Q3TR08 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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