Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQR0

Pgap2, Post-GPI attachment to proteins factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgap2Q3TQR0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pgap2Q3TQR0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pgap2Q3TQR0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pgap2Q3TQR0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pgap2Q3TQR0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgap2Q3TQR0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgap2Q3TQR0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgap2Q3TQR0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgap2Q3TQR0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgap2Q3TQR0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgap2Q3TQR0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgap2Q3TQR0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgap2Q3TQR0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgap2Q3TQR0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgap2Q3TQR0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgap2Q3TQR0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgap2Q3TQR0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgap2Q3TQR0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgap2Q3TQR0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pgap2Q3TQR0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pgap2Q3TQR0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms