Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
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Shroom4Q1W617 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
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Shroom4Q1W617 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
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Shroom4Q1W617 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
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Shroom4Q1W617 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
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Shroom4Q1W617 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
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Shroom4Q1W617 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
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Shroom4Q1W617 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
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Shroom4Q1W617 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
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Shroom4Q1W617 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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Shroom4Q1W617 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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Shroom4Q1W617 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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Shroom4Q1W617 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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Shroom4Q1W617 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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Shroom4Q1W617 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
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Shroom4Q1W617 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
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Shroom4Q1W617 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
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Shroom4Q1W617 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
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