Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
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Rpusd2Q149F1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Rpusd2Q149F1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Rpusd2Q149F1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Rpusd2Q149F1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Rpusd2Q149F1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Rpusd2Q149F1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Rpusd2Q149F1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Rpusd2Q149F1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Rpusd2Q149F1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Rpusd2Q149F1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd2Q149F1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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