Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Ttc39dQ0VF76 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Ttc39dQ0VF76 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Ttc39dQ0VF76 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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