Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisal1Q0VBP7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms