Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pglyrp4Q0VB07 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pglyrp4Q0VB07 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pglyrp4Q0VB07 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pglyrp4Q0VB07 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pglyrp4Q0VB07 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pglyrp4Q0VB07 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pglyrp4Q0VB07 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pglyrp4Q0VB07 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pglyrp4Q0VB07 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pglyrp4Q0VB07 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pglyrp4Q0VB07 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pglyrp4Q0VB07 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pglyrp4Q0VB07 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pglyrp4Q0VB07 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pglyrp4Q0VB07 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Pglyrp4Q0VB07 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pglyrp4Q0VB07 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pglyrp4Q0VB07 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Pglyrp4Q0VB07 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pglyrp4Q0VB07 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Pglyrp4Q0VB07 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pglyrp4Q0VB07 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Pglyrp4Q0VB07 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pglyrp4Q0VB07 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pglyrp4Q0VB07 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Pglyrp4Q0VB07 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Pglyrp4Q0VB07 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pglyrp4Q0VB07 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pglyrp4Q0VB07 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pglyrp4Q0VB07 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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