Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NeblQ0II04 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms