Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sh3bp2Q06649 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms