Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Thbs3Q05895 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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