Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rcn1Q05186 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms