Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox12Q04890 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms