Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1cQ01815 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms