Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms