Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja5Q01231 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms