Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms