Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga4Q00651 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms