Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms