Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8a1Q00558 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
F8a1Q00558 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms