Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms