Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx2Q00262 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms