Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata5P97489 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms