Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smyd1P97443 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms