Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmsP97355 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmsP97355 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmsP97355 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmsP97355 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmsP97355 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmsP97355 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmsP97355 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmsP97355 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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SmsP97355 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SmsP97355 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmsP97355 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmsP97355 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmsP97355 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SmsP97355 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmsP97355 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmsP97355 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmsP97355 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SmsP97355 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmsP97355 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmsP97355 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmsP97355 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmsP97355 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmsP97355 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmsP97355 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmsP97355 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmsP97355 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmsP97355 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SmsP97355 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmsP97355 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmsP97355 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SmsP97355 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SmsP97355 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SmsP97355 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmsP97355 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SmsP97355 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SmsP97355 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SmsP97355 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SmsP97355 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SmsP97355 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmsP97355 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmsP97355 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmsP97355 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SmsP97355 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms