Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms