Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cbx1P83917 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms