Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx2P81066 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx2P81066 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx2P81066 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms