Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldb1P70662 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms