Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad1P70340 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad1P70340 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad1P70340 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad1P70340 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad1P70340 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms