Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms