Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf6P70279 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf6P70279 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Surf6P70279 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms