Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s1P61967 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s1P61967 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s1P61967 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s1P61967 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s1P61967 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s1P61967 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s1P61967 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s1P61967 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s1P61967 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s1P61967 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s1P61967 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s1P61967 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s1P61967 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s1P61967 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms