Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2fP61219 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms