Protein–RNA interactions for Protein: P61211

Arl1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl1P61211 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl1P61211 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl1P61211 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl1P61211 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms