Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PlnP61014 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PlnP61014 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PlnP61014 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PlnP61014 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PlnP61014 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
PlnP61014 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PlnP61014 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PlnP61014 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PlnP61014 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PlnP61014 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PlnP61014 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PlnP61014 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PlnP61014 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PlnP61014 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PlnP61014 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms