Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

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Length 70 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sem1P60897 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sem1P60897 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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