Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ActbP60710 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms