Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppfia3P60469 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms