Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace1P56818 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms